L'EUSS està dirigida pel Patronat de la Fundació Rinaldi, organisme que marca les línies estratègiques de l'escola.
Des d'un punt de vista més operatiu, l'escola està dirigida pel director juntament amb el seu equip directiu, format pel cap d'estudis, pels coordinadors d'àrea (Àrea Universitat-Empresa i Innovació Docent i Àrea de l'Estudiant), l'administradora i la secretària acadèmica.
El Consell Mixt està format per persones representants de la Universitat Autònoma de Barcelona, de l'EUSS, del Patronat de la Fundació i representants de la comunitat d'estudiants.
L'àrea acadèmica es divideix, a més, en els departaments d'Electricitat, Electrònica, Mecànica, Organització Industrial, Formació Bàsica, Màsters i el Departament de projectes.
Cada àrea pot tenir associat un o diversos serveis (publicacions, gestió acadèmica, borsa de treball, biblioteca, etc.)
Existeixen, a més, diversos òrgans col·legiats (claustre, etc.) i diverses comissions de treball (la Comissió Acadèmica i de Qualitat, la Comissió d'alumnes, etc). Algunes comissions tenen persones externes com a membres d'aquesta, perquè la societat civil pugui proporcionar les seves opinions sobre les titulacions que ofereix l'escola.